Faleceu a 24 de Fevereiro de 2008, com 79 anos de idade, vítima de doença prolongada, o sacerdote Manuel Pereira Júnior, que serviu o Santuário de Fátima como capelão mais de quarenta anos. O Santuário recorda sobretudo a dedicação e o zelo apostólico colocados pelo Padre Pereira no serviço que prestava no acolhimento aos peregrinos de Nossa Senhora. A celebração das exéquias fúnebres teve lugar esta tarde, 25 de Fevereiro, na Basílica do Santuário de Fátima, que acolheu centenas de pessoas que quiseram por esta forma prestar ao falecido padre a sua última homenagem. Em grande número, participaram na celebração os familiares do P. Pereira Júnior, muitos habitantes da freguesia de Fátima, funcionários dos vários serviços do Santuário de Fátima e clero diocesano e a residir na Diocese de Leiria-Fátima, que concelebrou. Presidiu às exéquias D. António Marto, bispo diocesano, que transmitiu “sentimentos profundos de comunhão e comunhão de sentimentos” nesta hora difícil quer para família enlutada quer para o presbitério de Leiria-Fátima. O Prelado entendeu deixar expresso publicamente “o reconhecimento pelo acompanhamento dedicado e delicado e pela assistência carinhosa” que foi dispensada ao Padre Pereira pela sua irmã Lúcia, que dele cuidou mais de perto durante os últimos anos. Num momento de dor, pela perda de um irmão, mas também de fé e de esperança, “porque proclamamos o desígnio de Deus sobre o homem”, D. António Marto, que tomou posse da Diocese de Leiria-Fátima em 25 de Junho de 2006, recordou uma visita que realizou ao Padre Pereira Júnior. “Conheci-o já na última fase da sua doença, mas ainda pude adivinhar pelo seu sorriso, não pelas suas palavras (porque) já não falava, e pela bondade do seu olhar o testemunho de serenidade e de confiança comue viveu o seu sofrimento”, afirmou D. António Marto. O corpo do Padre Manuel Pereira Júnior foi a sepultar no Cemitério Paroquial de Fátima.